More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0014 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
230 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  72.61 
 
 
230 aa  364  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  73.48 
 
 
230 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  52.81 
 
 
231 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  55.41 
 
 
231 aa  268  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  52.38 
 
 
231 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  52.38 
 
 
231 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  50.48 
 
 
228 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.4 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  48.44 
 
 
220 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  47.4 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.45 
 
 
197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.44 
 
 
221 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  47.92 
 
 
220 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.35 
 
 
198 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.12 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
220 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  46.35 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  45.6 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  46.15 
 
 
200 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  45.6 
 
 
197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  44.79 
 
 
221 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.15 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  46.15 
 
 
198 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.05 
 
 
198 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  42.78 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.24 
 
 
200 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.09 
 
 
199 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.95 
 
 
196 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.55 
 
 
202 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  40.53 
 
 
201 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  40.98 
 
 
189 aa  159  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  43.17 
 
 
205 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.11 
 
 
201 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.89 
 
 
243 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  40.93 
 
 
201 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.54 
 
 
205 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  39.58 
 
 
215 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  42.02 
 
 
201 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.88 
 
 
198 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  41.3 
 
 
200 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
206 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  42.16 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  39.56 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
201 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  40.59 
 
 
205 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
201 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.35 
 
 
213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
201 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  41.54 
 
 
196 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.08 
 
 
207 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  41.67 
 
 
199 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.42 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  40.96 
 
 
202 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  37.63 
 
 
201 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.86 
 
 
202 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  39.9 
 
 
199 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  40.4 
 
 
202 aa  141  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  38.67 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.82 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.46 
 
 
204 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  37.82 
 
 
201 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  38.04 
 
 
206 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.79 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.15 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.8 
 
 
199 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.81 
 
 
200 aa  128  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
374 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  34.07 
 
 
220 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  34.24 
 
 
201 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.77 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  36.09 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.89 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.46 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.52 
 
 
202 aa  109  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
242 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.22 
 
 
204 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  30.91 
 
 
270 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  34.68 
 
 
234 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.57 
 
 
501 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  32.7 
 
 
234 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.82 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.57 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.9 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.44 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
570 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  29.88 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.96 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.34 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.41 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.18 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.17 
 
 
322 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.77 
 
 
321 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>