More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2568 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
258 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  86.82 
 
 
258 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  60.39 
 
 
259 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.98 
 
 
249 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.86 
 
 
251 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  56.52 
 
 
256 aa  275  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  49.16 
 
 
315 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  49.16 
 
 
315 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  51.16 
 
 
262 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.78 
 
 
262 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 
256 aa  260  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  47.15 
 
 
262 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 
247 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  48.82 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.31 
 
 
233 aa  215  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  40.32 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
249 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  42.41 
 
 
495 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  50.57 
 
 
319 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  37.01 
 
 
259 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  39.15 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.4 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  38.74 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  37.7 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
262 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.31 
 
 
234 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 
259 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  36.51 
 
 
259 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.65 
 
 
262 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.65 
 
 
262 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  37.89 
 
 
262 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.7 
 
 
261 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.51 
 
 
263 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.25 
 
 
263 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
241 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35 
 
 
240 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  36.22 
 
 
258 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.86 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.25 
 
 
263 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  37.11 
 
 
262 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
255 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
258 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.55 
 
 
259 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.11 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 
263 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.18 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.61 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  35.06 
 
 
263 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  36.6 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  35.32 
 
 
241 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.94 
 
 
262 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  36.24 
 
 
257 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.43 
 
 
256 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.22 
 
 
263 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 
263 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.09 
 
 
253 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  37.11 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  34.66 
 
 
257 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  36.09 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
239 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  35.59 
 
 
255 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  35.59 
 
 
255 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
234 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.86 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.41 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  36.13 
 
 
215 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.02 
 
 
263 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  34.89 
 
 
263 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  38.31 
 
 
234 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.55 
 
 
234 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  37.16 
 
 
234 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.76 
 
 
517 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.77 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.72 
 
 
501 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  37.89 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.53 
 
 
297 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.22 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.04 
 
 
301 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  35 
 
 
319 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.81 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.91 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.91 
 
 
301 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.58 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.55 
 
 
221 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.71 
 
 
197 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.54 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
374 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.12 
 
 
465 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.99 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.36 
 
 
335 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.46 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.77 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.65 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>