More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2134 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
302 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.88 
 
 
311 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.92 
 
 
319 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.84 
 
 
315 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.49 
 
 
328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.39 
 
 
315 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.37 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.91 
 
 
315 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.28 
 
 
313 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 
337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.23 
 
 
315 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.05 
 
 
313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.62 
 
 
341 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 
337 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.95 
 
 
313 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.64 
 
 
313 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.78 
 
 
337 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.29 
 
 
317 aa  332  5e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.63 
 
 
318 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.67 
 
 
302 aa  331  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 
337 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.03 
 
 
297 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.03 
 
 
297 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 
310 aa  329  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.43 
 
 
322 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.74 
 
 
315 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.22 
 
 
338 aa  328  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.55 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 
319 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.3 
 
 
319 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.25 
 
 
317 aa  325  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.2 
 
 
337 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.56 
 
 
306 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.94 
 
 
311 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  322  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  322  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  50.3 
 
 
334 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  50.3 
 
 
334 aa  322  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  322  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.14 
 
 
353 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  321  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.2 
 
 
335 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
334 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.53 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.14 
 
 
316 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.9 
 
 
331 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.3 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.22 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.27 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.29 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.95 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 
331 aa  318  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.71 
 
 
331 aa  318  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.91 
 
 
322 aa  318  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.95 
 
 
331 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.52 
 
 
336 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.24 
 
 
366 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.24 
 
 
366 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.33 
 
 
298 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
337 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.95 
 
 
331 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.16 
 
 
319 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.5 
 
 
334 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.62 
 
 
331 aa  316  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.77 
 
 
301 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.5 
 
 
334 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.04 
 
 
331 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.5 
 
 
334 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.04 
 
 
331 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.04 
 
 
331 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.04 
 
 
331 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.04 
 
 
331 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.85 
 
 
333 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  49.1 
 
 
337 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.31 
 
 
344 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.15 
 
 
332 aa  315  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.94 
 
 
366 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.2 
 
 
334 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.2 
 
 
334 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.57 
 
 
332 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.24 
 
 
338 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0621  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.19 
 
 
317 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.57 
 
 
332 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
344 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
344 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
344 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
344 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
344 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.54 
 
 
333 aa  314  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.39 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.16 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.7 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.13 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.69 
 
 
344 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.69 
 
 
344 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.25 
 
 
333 aa  311  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.72 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.39 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>