More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1134 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
336 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  82.98 
 
 
331 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  82.32 
 
 
332 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  82.01 
 
 
332 aa  534  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.13 
 
 
335 aa  524  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.51 
 
 
332 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  78.9 
 
 
332 aa  511  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.45 
 
 
353 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.64 
 
 
334 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.43 
 
 
326 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.08 
 
 
331 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.7 
 
 
331 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.22 
 
 
331 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.52 
 
 
334 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.05 
 
 
336 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.31 
 
 
331 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.41 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.3 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  64 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.64 
 
 
320 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  64 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.78 
 
 
331 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.56 
 
 
331 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.98 
 
 
331 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.04 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.35 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.58 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.15 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.01 
 
 
331 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.01 
 
 
331 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.75 
 
 
310 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
311 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.44 
 
 
316 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.25 
 
 
322 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.93 
 
 
337 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.35 
 
 
337 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  57.68 
 
 
315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  55.93 
 
 
337 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.93 
 
 
336 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.06 
 
 
336 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.06 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0621  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.66 
 
 
317 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.68 
 
 
341 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.09 
 
 
319 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.89 
 
 
301 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.76 
 
 
337 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.09 
 
 
319 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.35 
 
 
337 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
332 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.72 
 
 
337 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.72 
 
 
337 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.78 
 
 
298 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.65 
 
 
301 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.65 
 
 
301 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.94 
 
 
319 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.65 
 
 
302 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.94 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.82 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.22 
 
 
306 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.7 
 
 
313 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.38 
 
 
331 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.96 
 
 
315 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.89 
 
 
330 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.38 
 
 
338 aa  339  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.75 
 
 
313 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.7 
 
 
313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.56 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.87 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.44 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1683  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.01 
 
 
323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.13 
 
 
317 aa  335  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.3 
 
 
326 aa  335  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
333 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 
333 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.82 
 
 
333 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.09 
 
 
315 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
317 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.22 
 
 
366 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.22 
 
 
366 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.22 
 
 
366 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.8 
 
 
300 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.83 
 
 
319 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.71 
 
 
305 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.47 
 
 
335 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.14 
 
 
311 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.07 
 
 
322 aa  328  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.92 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.52 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.76 
 
 
344 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.07 
 
 
344 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.46 
 
 
344 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.46 
 
 
344 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.46 
 
 
344 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>