More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1410 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.34 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.04 
 
 		 301 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.44 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.86 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.21 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.03 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.2 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.37 
 
 		 306 aa  352  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.84 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.2 
 
 		 302 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.56 
 
 		 320 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.03 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.03 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.23 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.73 
 
 		 336 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.65 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.31 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.63 
 
 		 331 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.17 
 
 		 315 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.54 
 
 		 337 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 		 331 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.15 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.7 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.75 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.84 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  53.85 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.48 
 
 		 344 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.71 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.67 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.34 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.48 
 
 		 331 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.4 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.55 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.95 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.55 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 		 331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.27 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.27 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.27 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.89 
 
 		 335 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.68 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.27 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.27 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.94 
 
 		 337 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.19 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.77 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.18 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.7 
 
 		 313 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.7 
 
 		 332 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.27 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.5 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 		 331 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.9 
 
 		 316 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.05 
 
 		 332 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.51 
 
 		 332 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.53 
 
 		 353 aa  328  9e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.21 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.38 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.12 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  52 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  52 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.98 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  52 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  52 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.7 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.98 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.12 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.87 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.7 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.82 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.81 
 
 		 344 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.89 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.69 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.27 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.6 
 
 		 340 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.19 
 
 		 344 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.86 
 
 		 331 aa  318  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.37 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.82 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.07 
 
 		 315 aa  318  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.98 
 
 		 345 aa  318  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.93 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.5 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.37 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  52.31 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.31 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.19 
 
 		 344 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  52.31 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 		 334 aa  315  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>