More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0396 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
334 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.16 
 
 
331 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.84 
 
 
353 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.03 
 
 
332 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  73.25 
 
 
336 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.73 
 
 
332 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
332 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
332 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.7 
 
 
335 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.06 
 
 
326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.41 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.41 
 
 
331 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.52 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.88 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.88 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.78 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.25 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
331 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.88 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.88 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.88 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.15 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.83 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.12 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.15 
 
 
331 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.16 
 
 
336 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.87 
 
 
331 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.82 
 
 
334 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.97 
 
 
331 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  67.97 
 
 
331 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.29 
 
 
311 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
331 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.39 
 
 
310 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.18 
 
 
331 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.31 
 
 
320 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.37 
 
 
316 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.25 
 
 
320 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0621  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.56 
 
 
317 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  57.37 
 
 
315 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.41 
 
 
322 aa  355  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.76 
 
 
315 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.68 
 
 
337 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.76 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.26 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.26 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.74 
 
 
318 aa  352  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.83 
 
 
315 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.59 
 
 
337 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  54.38 
 
 
337 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.45 
 
 
337 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.96 
 
 
336 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.97 
 
 
336 aa  348  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.55 
 
 
337 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.86 
 
 
322 aa  345  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.28 
 
 
313 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.85 
 
 
337 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.28 
 
 
313 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.87 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.55 
 
 
317 aa  338  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.16 
 
 
301 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.57 
 
 
319 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.26 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.14 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
331 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.78 
 
 
306 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.56 
 
 
328 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
332 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.53 
 
 
315 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.08 
 
 
366 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.08 
 
 
366 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.08 
 
 
366 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.21 
 
 
334 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
334 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
334 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.5 
 
 
313 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
334 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  52.91 
 
 
334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  52.91 
 
 
334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.91 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.11 
 
 
298 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.21 
 
 
334 aa  328  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
334 aa  328  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
317 aa  328  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.52 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.99 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.62 
 
 
326 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.07 
 
 
315 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
344 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.88 
 
 
301 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>