More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4784 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
337 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  86.65 
 
 
337 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  86.35 
 
 
337 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  82.49 
 
 
337 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  81.31 
 
 
337 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  80.71 
 
 
341 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.82 
 
 
337 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.81 
 
 
337 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.81 
 
 
337 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.81 
 
 
336 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.22 
 
 
336 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.16 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.51 
 
 
330 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.39 
 
 
335 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.92 
 
 
366 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.92 
 
 
366 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 
366 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.44 
 
 
315 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.51 
 
 
344 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.57 
 
 
331 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.09 
 
 
317 aa  364  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.17 
 
 
298 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.57 
 
 
331 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 
316 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.31 
 
 
331 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.51 
 
 
331 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.27 
 
 
331 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.17 
 
 
310 aa  361  8e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 
331 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.79 
 
 
333 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.57 
 
 
331 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.24 
 
 
331 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.73 
 
 
331 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.22 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.31 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.22 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.13 
 
 
319 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.13 
 
 
319 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
332 aa  355  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.15 
 
 
333 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.52 
 
 
331 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.79 
 
 
315 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.33 
 
 
331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.23 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 
334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 
334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 
334 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.02 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  351  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.63 
 
 
334 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  55.32 
 
 
334 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  55.32 
 
 
334 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.32 
 
 
334 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.18 
 
 
341 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.71 
 
 
334 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.35 
 
 
336 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.28 
 
 
332 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.43 
 
 
313 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.41 
 
 
302 aa  348  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
333 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.91 
 
 
320 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.13 
 
 
313 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  56 
 
 
353 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.52 
 
 
344 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.69 
 
 
331 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.65 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.05 
 
 
331 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.95 
 
 
344 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.64 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.95 
 
 
344 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.43 
 
 
333 aa  342  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.95 
 
 
344 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.95 
 
 
344 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.56 
 
 
319 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.52 
 
 
333 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.65 
 
 
344 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.59 
 
 
336 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.52 
 
 
344 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.92 
 
 
338 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.65 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.41 
 
 
306 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.71 
 
 
334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.47 
 
 
331 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.47 
 
 
331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.46 
 
 
320 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.8 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.58 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.21 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>