More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3640 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.7 
 
 		 334 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 		 334 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.7 
 
 		 334 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.7 
 
 		 334 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 		 334 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  88.92 
 
 		 334 aa  620  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  88.92 
 
 		 334 aa  620  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.92 
 
 		 334 aa  620  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.92 
 
 		 334 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.92 
 
 		 334 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.92 
 
 		 334 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.62 
 
 		 334 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  88.92 
 
 		 334 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  88.02 
 
 		 334 aa  613  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  84.34 
 
 		 333 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  81.74 
 
 		 333 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.04 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  78.74 
 
 		 366 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.04 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  78.74 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.05 
 
 		 333 aa  530  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  78.44 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.75 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.14 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.22 
 
 		 335 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.06 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.88 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.28 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.46 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.98 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.97 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.97 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.97 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.33 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.97 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.36 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.79 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.43 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.15 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.49 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.66 
 
 		 341 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.14 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.35 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.23 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.38 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.38 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.77 
 
 		 315 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.54 
 
 		 313 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.17 
 
 		 319 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 		 313 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.02 
 
 		 315 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.33 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  55.02 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.03 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.59 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.94 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.21 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.4 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.95 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.01 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.96 
 
 		 341 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.92 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 		 331 aa  331  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.05 
 
 		 337 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.84 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.79 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.07 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.96 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.02 
 
 		 316 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.14 
 
 		 331 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.38 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  57.46 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.91 
 
 		 315 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.04 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.02 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.37 
 
 		 331 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.14 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.52 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.37 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.51 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.37 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.69 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.51 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.79 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.14 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.16 
 
 		 331 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>