More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0311 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
331 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  99.7 
 
 
344 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  97.89 
 
 
331 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  95.77 
 
 
331 aa  630  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  95.47 
 
 
331 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  95.47 
 
 
331 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  94.56 
 
 
331 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  85.8 
 
 
331 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  84.29 
 
 
331 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  85.5 
 
 
331 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  84.89 
 
 
331 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.69 
 
 
331 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.99 
 
 
331 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.12 
 
 
331 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.25 
 
 
331 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.51 
 
 
331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.27 
 
 
334 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.12 
 
 
336 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.92 
 
 
320 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.81 
 
 
320 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.75 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.72 
 
 
332 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.2 
 
 
331 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.35 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.61 
 
 
310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.84 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.83 
 
 
332 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
334 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.92 
 
 
332 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.61 
 
 
332 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
326 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.81 
 
 
311 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.37 
 
 
319 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.37 
 
 
319 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.36 
 
 
337 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.43 
 
 
318 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.35 
 
 
317 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.6 
 
 
322 aa  364  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.1 
 
 
313 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
344 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.8 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.52 
 
 
337 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.8 
 
 
331 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0621  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.73 
 
 
317 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  56.92 
 
 
315 aa  360  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.06 
 
 
337 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.3 
 
 
337 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.75 
 
 
302 aa  358  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.23 
 
 
337 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.07 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  53.99 
 
 
337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.52 
 
 
366 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.52 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.89 
 
 
313 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
344 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
319 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.21 
 
 
366 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 
313 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.6 
 
 
344 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.76 
 
 
344 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.43 
 
 
315 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.78 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
344 aa  352  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.49 
 
 
337 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.82 
 
 
333 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.56 
 
 
316 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
344 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.8 
 
 
315 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
333 aa  348  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
333 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.71 
 
 
330 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.29 
 
 
324 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.31 
 
 
306 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.17 
 
 
313 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.72 
 
 
336 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.31 
 
 
298 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.85 
 
 
301 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.27 
 
 
317 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.44 
 
 
338 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 
301 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 
301 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.15 
 
 
336 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.91 
 
 
328 aa  337  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.83 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.84 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.83 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.83 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.51 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.83 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>