More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3680 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
331 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  85.59 
 
 
333 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  84.08 
 
 
333 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  79.88 
 
 
333 aa  564  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.18 
 
 
333 aa  564  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.18 
 
 
366 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.48 
 
 
366 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.18 
 
 
366 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  76.35 
 
 
334 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.35 
 
 
334 aa  534  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  76.35 
 
 
334 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.35 
 
 
334 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.35 
 
 
334 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.35 
 
 
334 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.05 
 
 
334 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.05 
 
 
334 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  75.75 
 
 
334 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.75 
 
 
334 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.45 
 
 
334 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.75 
 
 
334 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.45 
 
 
334 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.45 
 
 
334 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.9 
 
 
333 aa  521  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.81 
 
 
317 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.87 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.3 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.87 
 
 
344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.18 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
344 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.25 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.55 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.69 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.31 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.69 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.88 
 
 
340 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.23 
 
 
338 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.67 
 
 
334 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.56 
 
 
347 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.18 
 
 
340 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.63 
 
 
341 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.95 
 
 
336 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.75 
 
 
338 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
319 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
319 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.52 
 
 
331 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.79 
 
 
337 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.45 
 
 
315 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.59 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.88 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.39 
 
 
337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.14 
 
 
337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.8 
 
 
336 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.36 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.28 
 
 
331 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
331 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  54.57 
 
 
337 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.36 
 
 
337 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.83 
 
 
315 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.78 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.73 
 
 
331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
331 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
331 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
331 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
331 aa  351  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
331 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.41 
 
 
316 aa  351  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.62 
 
 
337 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.04 
 
 
319 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.8 
 
 
331 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.87 
 
 
344 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.35 
 
 
331 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.83 
 
 
313 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.28 
 
 
319 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.45 
 
 
337 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.87 
 
 
331 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.49 
 
 
331 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.63 
 
 
336 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.66 
 
 
315 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.94 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.01 
 
 
331 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.05 
 
 
311 aa  345  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.98 
 
 
322 aa  344  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.49 
 
 
317 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.31 
 
 
310 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.39 
 
 
297 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.46 
 
 
317 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.79 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.28 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.07 
 
 
297 aa  342  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
320 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.28 
 
 
331 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.56 
 
 
297 aa  341  9e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.56 
 
 
313 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.25 
 
 
313 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.15 
 
 
328 aa  340  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>