More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2345 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
347 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  75 
 
 
345 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.05 
 
 
344 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.05 
 
 
344 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.05 
 
 
344 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.76 
 
 
344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.47 
 
 
344 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.18 
 
 
344 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.61 
 
 
344 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  71.81 
 
 
340 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.57 
 
 
334 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.34 
 
 
338 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  73.57 
 
 
336 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.04 
 
 
340 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.09 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.88 
 
 
338 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.06 
 
 
335 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.11 
 
 
341 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.85 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.21 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.06 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.09 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.79 
 
 
334 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.79 
 
 
334 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.09 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.54 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.79 
 
 
334 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.06 
 
 
333 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.87 
 
 
331 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.33 
 
 
366 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.02 
 
 
366 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.33 
 
 
366 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  58.66 
 
 
334 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 
334 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 
334 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 
334 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  58.66 
 
 
334 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.66 
 
 
334 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.36 
 
 
334 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.64 
 
 
333 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.36 
 
 
334 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.75 
 
 
317 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.45 
 
 
319 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.45 
 
 
319 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.99 
 
 
331 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.43 
 
 
331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.63 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.58 
 
 
319 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.45 
 
 
320 aa  335  7e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.92 
 
 
335 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.22 
 
 
313 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.07 
 
 
320 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.62 
 
 
328 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.2 
 
 
331 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.2 
 
 
331 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.42 
 
 
330 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.9 
 
 
331 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.69 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.38 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.91 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
341 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
337 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  51.82 
 
 
337 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
331 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
344 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.89 
 
 
337 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.05 
 
 
337 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.69 
 
 
315 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.13 
 
 
337 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
331 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.06 
 
 
305 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.54 
 
 
315 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.29 
 
 
331 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.38 
 
 
337 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.29 
 
 
331 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.58 
 
 
336 aa  322  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.13 
 
 
337 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.17 
 
 
331 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.06 
 
 
311 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.05 
 
 
332 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.89 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.54 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.87 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.55 
 
 
336 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.23 
 
 
298 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.85 
 
 
331 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.18 
 
 
324 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.45 
 
 
332 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.26 
 
 
302 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.31 
 
 
316 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.11 
 
 
331 aa  315  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>