More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1013 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
313 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  73.02 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.7 
 
 
315 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.4 
 
 
319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.4 
 
 
319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.79 
 
 
315 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  69.44 
 
 
319 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.89 
 
 
317 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.13 
 
 
337 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.73 
 
 
298 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.83 
 
 
341 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.69 
 
 
302 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.62 
 
 
337 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.93 
 
 
337 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.22 
 
 
337 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.38 
 
 
336 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.93 
 
 
337 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  56.62 
 
 
337 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.13 
 
 
331 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  55 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.29 
 
 
333 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.06 
 
 
306 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.75 
 
 
333 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.21 
 
 
331 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.93 
 
 
334 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.93 
 
 
334 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.17 
 
 
331 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.19 
 
 
335 aa  358  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.23 
 
 
318 aa  358  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.4 
 
 
366 aa  358  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.63 
 
 
334 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.63 
 
 
334 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.4 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.1 
 
 
366 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.71 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.01 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.28 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.79 
 
 
366 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.66 
 
 
344 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  57.01 
 
 
334 aa  355  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.4 
 
 
337 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.79 
 
 
344 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.63 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.62 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  57.62 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.62 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  57.62 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.94 
 
 
316 aa  354  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.62 
 
 
334 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.62 
 
 
334 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.62 
 
 
334 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 
344 aa  352  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.17 
 
 
331 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.92 
 
 
331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.04 
 
 
344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.69 
 
 
335 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.23 
 
 
331 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.2 
 
 
317 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.89 
 
 
336 aa  349  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.89 
 
 
333 aa  349  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 
333 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.92 
 
 
331 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.96 
 
 
311 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.69 
 
 
344 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.41 
 
 
313 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.92 
 
 
331 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.69 
 
 
331 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.83 
 
 
334 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.89 
 
 
328 aa  346  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.05 
 
 
336 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.69 
 
 
331 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.33 
 
 
301 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.41 
 
 
315 aa  342  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.41 
 
 
310 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.43 
 
 
338 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
341 aa  341  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.94 
 
 
344 aa  340  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
331 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
331 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.41 
 
 
320 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.05 
 
 
302 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
331 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
331 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
331 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.94 
 
 
331 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.46 
 
 
313 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.14 
 
 
332 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.94 
 
 
305 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.59 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.87 
 
 
336 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.44 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.51 
 
 
313 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.37 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.94 
 
 
317 aa  336  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.54 
 
 
331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>