More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2123 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
336 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.18 
 
 
338 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.49 
 
 
344 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.19 
 
 
344 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  76.19 
 
 
344 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.6 
 
 
344 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.4 
 
 
344 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.7 
 
 
344 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.7 
 
 
344 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.3 
 
 
344 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.7 
 
 
344 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.4 
 
 
345 aa  524  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.7 
 
 
344 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.37 
 
 
334 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  70.45 
 
 
340 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  72.97 
 
 
347 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.17 
 
 
340 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.61 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.11 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.43 
 
 
333 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.88 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.35 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.66 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.35 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.66 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.66 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.57 
 
 
366 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.04 
 
 
334 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.57 
 
 
366 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.74 
 
 
341 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  59.45 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  59.45 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.45 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.95 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.54 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.15 
 
 
334 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.45 
 
 
334 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.45 
 
 
334 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.3 
 
 
335 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.45 
 
 
334 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.45 
 
 
334 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  59.15 
 
 
334 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.04 
 
 
333 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.59 
 
 
333 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.9 
 
 
333 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.83 
 
 
317 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
319 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.97 
 
 
319 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.11 
 
 
331 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.11 
 
 
331 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.61 
 
 
324 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.42 
 
 
331 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.29 
 
 
328 aa  340  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.35 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.73 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.23 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.36 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.42 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.17 
 
 
320 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.48 
 
 
330 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.21 
 
 
334 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.54 
 
 
315 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.8 
 
 
320 aa  331  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.91 
 
 
316 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.66 
 
 
305 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.92 
 
 
315 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.24 
 
 
317 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.27 
 
 
331 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.27 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.99 
 
 
336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.6 
 
 
322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  52 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.36 
 
 
315 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.17 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.7 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.17 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.68 
 
 
298 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.3 
 
 
331 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.06 
 
 
331 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.76 
 
 
315 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.86 
 
 
331 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.04 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.21 
 
 
336 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
331 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  59.32 
 
 
306 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.15 
 
 
335 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.82 
 
 
331 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.93 
 
 
331 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.63 
 
 
332 aa  322  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.86 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.79 
 
 
313 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  50.46 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.46 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.76 
 
 
302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.49 
 
 
313 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.04 
 
 
317 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>