More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1510 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
262 aa  551  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.9 
 
 
263 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.28 
 
 
263 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  68.35 
 
 
258 aa  358  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  60.15 
 
 
259 aa  358  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.85 
 
 
263 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  67.33 
 
 
263 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  62.36 
 
 
263 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  65.02 
 
 
263 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  68.13 
 
 
263 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  67.73 
 
 
263 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.14 
 
 
262 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  62.95 
 
 
257 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  61.66 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.56 
 
 
263 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.56 
 
 
263 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  63.04 
 
 
257 aa  338  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  64.98 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.87 
 
 
262 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  59.53 
 
 
258 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.71 
 
 
262 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.71 
 
 
262 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  63.71 
 
 
262 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  61.45 
 
 
258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  63.29 
 
 
262 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.45 
 
 
262 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  58.3 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  59.92 
 
 
259 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  58.3 
 
 
259 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.66 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  57.49 
 
 
259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  61.86 
 
 
255 aa  315  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  58.58 
 
 
260 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.03 
 
 
256 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  56.91 
 
 
259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  58.37 
 
 
249 aa  310  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  59.32 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  58.16 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  59.81 
 
 
215 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  53.48 
 
 
241 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  58.6 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  58.14 
 
 
255 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.42 
 
 
239 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  45.56 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  51.05 
 
 
241 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.61 
 
 
262 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.61 
 
 
262 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  39.04 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.8 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
258 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
258 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  39.06 
 
 
234 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  36.78 
 
 
262 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.91 
 
 
234 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.91 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.97 
 
 
240 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.52 
 
 
249 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.19 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.07 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.11 
 
 
251 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.96 
 
 
256 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.1 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.38 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  31.97 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.13 
 
 
253 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.86 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  38.75 
 
 
315 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.97 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  38.12 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.75 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.37 
 
 
495 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.1 
 
 
501 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 
517 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.83 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.91 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.12 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  32.54 
 
 
227 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.81 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.41 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.72 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.81 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.81 
 
 
331 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.81 
 
 
331 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.11 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.82 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.51 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>