More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0620 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.73 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  73.39 
 
 		 258 aa  400  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.73 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  73.9 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.33 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  71.94 
 
 		 263 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  71.94 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.33 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.33 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  72.22 
 
 		 263 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  75 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.37 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  71.37 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.37 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  70.56 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  71.6 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  70.56 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  70.16 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  67.32 
 
 		 257 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.4 
 
 		 263 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.4 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  72.24 
 
 		 263 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.35 
 
 		 262 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  63.04 
 
 		 262 aa  356  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  69.17 
 
 		 263 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  65.18 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  71.37 
 
 		 263 aa  351  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  70.54 
 
 		 263 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  67.59 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  61.13 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  60.08 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  59.84 
 
 		 258 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  60.08 
 
 		 259 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  59.67 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  58.7 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  57.42 
 
 		 260 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  60.64 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.63 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.03 
 
 		 256 aa  307  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  58.9 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  56.07 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  58.47 
 
 		 249 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  60.28 
 
 		 215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.08 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  59.35 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  59.35 
 
 		 255 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  55.51 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  51.64 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.42 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  43.29 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  41.13 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  41.13 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  39.39 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.65 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.44 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.11 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.51 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.8 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.9 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.9 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.29 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.46 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.2 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  33.73 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.66 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.66 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.98 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.54 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  30.07 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.42 
 
 		 501 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.19 
 
 		 495 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.37 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.8 
 
 		 331 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.22 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.53 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.06 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.77 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.59 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.78 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.22 
 
 		 326 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.96 
 
 		 332 aa  86.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.24 
 
 		 318 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 		 332 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 332 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.54 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.19 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.95 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.51 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.78 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.87 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>