More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0491 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.99 
 
 
251 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.31 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  55.34 
 
 
259 aa  275  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  54.09 
 
 
258 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  52.92 
 
 
258 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  56.18 
 
 
256 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  46.18 
 
 
315 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  46.18 
 
 
315 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  47.73 
 
 
262 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  46.59 
 
 
262 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  47.73 
 
 
262 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  43.82 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  43.82 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
247 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.96 
 
 
233 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  50.9 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.94 
 
 
240 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  38.17 
 
 
260 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  43.72 
 
 
495 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  50.31 
 
 
318 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  36.82 
 
 
259 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  40.24 
 
 
249 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  36.72 
 
 
259 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  37.4 
 
 
258 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  36.65 
 
 
258 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  36.25 
 
 
258 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.4 
 
 
261 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  35.39 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.65 
 
 
256 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  36.25 
 
 
259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.79 
 
 
253 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.16 
 
 
234 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  36.4 
 
 
255 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 
255 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  38.49 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.2 
 
 
262 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  35.74 
 
 
262 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.8 
 
 
262 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.8 
 
 
262 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  36.8 
 
 
262 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.8 
 
 
259 aa  145  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  37.02 
 
 
255 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  36.8 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  36.4 
 
 
262 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  37.45 
 
 
215 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  37.02 
 
 
255 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  36.47 
 
 
257 aa  141  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  36 
 
 
262 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.71 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  39.44 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.6 
 
 
263 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  36.73 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
263 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.96 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.2 
 
 
263 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  35.34 
 
 
263 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  38.56 
 
 
241 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.08 
 
 
257 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  36.4 
 
 
263 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.47 
 
 
263 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.84 
 
 
262 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  36.08 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  34.13 
 
 
263 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.53 
 
 
234 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 
234 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.9 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  33.59 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.97 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
517 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.03 
 
 
297 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.03 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.33 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
297 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.08 
 
 
301 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.63 
 
 
200 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.97 
 
 
297 aa  89  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.33 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.05 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.94 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.11 
 
 
232 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.37 
 
 
301 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.75 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0436  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.72 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.47 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  29.47 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.59 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.81 
 
 
311 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.62 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1683  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.12 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.91 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>