More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3725 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  84.31 
 
 
255 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.37 
 
 
256 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  70.75 
 
 
258 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  71.89 
 
 
258 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  70.59 
 
 
255 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  69.8 
 
 
255 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  75.81 
 
 
215 aa  360  9e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  59.32 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  60.67 
 
 
263 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.14 
 
 
263 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.14 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.68 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  58.68 
 
 
262 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.26 
 
 
262 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  57.44 
 
 
258 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59 
 
 
263 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.26 
 
 
262 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.26 
 
 
262 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  58.26 
 
 
262 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  56.9 
 
 
263 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.97 
 
 
259 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.02 
 
 
249 aa  290  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.9 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.58 
 
 
262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  56.07 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  58.58 
 
 
258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  54.13 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  56.78 
 
 
263 aa  277  9e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  53.14 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  56.78 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  52.59 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  51.43 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  50.82 
 
 
259 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  52.67 
 
 
259 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  51.64 
 
 
259 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
239 aa  265  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  52.36 
 
 
241 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.81 
 
 
261 aa  265  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  54.69 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  51.44 
 
 
259 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  54.29 
 
 
263 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  52.79 
 
 
241 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  44.88 
 
 
263 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.14 
 
 
240 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.55 
 
 
256 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
258 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 
258 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  36.29 
 
 
262 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.45 
 
 
256 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 
234 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  35.71 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.69 
 
 
262 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.69 
 
 
262 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.4 
 
 
251 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.66 
 
 
234 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.8 
 
 
234 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.66 
 
 
234 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.58 
 
 
233 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.55 
 
 
249 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.28 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.43 
 
 
247 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.02 
 
 
247 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.12 
 
 
234 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
247 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  39.49 
 
 
495 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.42 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.99 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.07 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.88 
 
 
501 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.46 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
199 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 
331 aa  95.5  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.37 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.65 
 
 
301 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.04 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.65 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.46 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
374 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.46 
 
 
336 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.05 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.41 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.41 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.13 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.94 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  35.14 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.96 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.81 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.81 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.89 
 
 
332 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.37 
 
 
331 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 
229 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.62 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.75 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>