More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4897 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  87.14 
 
 
241 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.7 
 
 
258 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  55.27 
 
 
258 aa  284  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.59 
 
 
263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.59 
 
 
263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  57.2 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  53.81 
 
 
258 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.78 
 
 
262 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.12 
 
 
262 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  53.81 
 
 
263 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.93 
 
 
262 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.93 
 
 
262 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  51.05 
 
 
262 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  55.51 
 
 
262 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  274  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.77 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.88 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.33 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.33 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.74 
 
 
261 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  56.71 
 
 
260 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  53.91 
 
 
259 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  55.51 
 
 
257 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  55.56 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  55.56 
 
 
255 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  52.79 
 
 
255 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 
263 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  51.07 
 
 
255 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  52.84 
 
 
259 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  53.71 
 
 
259 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.92 
 
 
259 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  51.5 
 
 
263 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.35 
 
 
215 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.02 
 
 
263 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  52.61 
 
 
259 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 
258 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  51.53 
 
 
257 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  52.86 
 
 
263 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.59 
 
 
262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.7 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  54.15 
 
 
263 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  53.71 
 
 
263 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  48.48 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  51.43 
 
 
263 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  39.84 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.22 
 
 
256 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  36.51 
 
 
258 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.98 
 
 
240 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.11 
 
 
258 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  38.52 
 
 
259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.94 
 
 
234 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.46 
 
 
262 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.46 
 
 
262 aa  141  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.5 
 
 
251 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 
247 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.8 
 
 
249 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  36.44 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.24 
 
 
256 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  34.47 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.62 
 
 
234 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.47 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.11 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.71 
 
 
253 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.14 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.46 
 
 
237 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.44 
 
 
501 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.09 
 
 
495 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.77 
 
 
465 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.28 
 
 
331 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.52 
 
 
331 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.02 
 
 
317 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.41 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.19 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.19 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.28 
 
 
331 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.19 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.28 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.19 
 
 
331 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.12 
 
 
344 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.19 
 
 
334 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.22 
 
 
311 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
331 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.24 
 
 
331 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.84 
 
 
319 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>