More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0663 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  48.26 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.08 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.73 
 
 
237 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.27 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  37.27 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  38.46 
 
 
189 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.12 
 
 
232 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.63 
 
 
200 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
501 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.85 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  35.57 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.08 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 
374 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.47 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  36.18 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.55 
 
 
505 aa  95.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  30.6 
 
 
196 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.12 
 
 
505 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  36.18 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  35.9 
 
 
270 aa  92.4  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  34.84 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  30.53 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  33.99 
 
 
259 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  29.77 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.47 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.87 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.18 
 
 
505 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  35.53 
 
 
257 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  34.19 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  31.41 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  33.11 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.62 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.61 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  33.11 
 
 
255 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  35.76 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
259 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.11 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
528 aa  89  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
255 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
206 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
242 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 
202 aa  86.7  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  34.87 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.2 
 
 
495 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.77 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.76 
 
 
263 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.24 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.38 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.76 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
570 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.65 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.14 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.89 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.31 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.64 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.31 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.14 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  31.94 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.44 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  33.55 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.11 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.44 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.13 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.64 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.55 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.57 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  34.44 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  33.55 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  32.24 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 
489 aa  82  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  33.11 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.25 
 
 
465 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.07 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.07 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.07 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.25 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  30.56 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.29 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>