More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4346 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.85 
 
 
251 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  53.21 
 
 
259 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  52.31 
 
 
258 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  50.46 
 
 
258 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.68 
 
 
249 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  44.53 
 
 
315 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  44.53 
 
 
315 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  48.21 
 
 
247 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  47.53 
 
 
262 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  48.83 
 
 
247 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  47.53 
 
 
262 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  45.52 
 
 
318 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  48.83 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.96 
 
 
256 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  46.98 
 
 
256 aa  190  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  46.01 
 
 
262 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  45.31 
 
 
495 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.91 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  43.48 
 
 
255 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  43.27 
 
 
249 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  36.76 
 
 
319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  42.51 
 
 
255 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  42.03 
 
 
255 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  40.87 
 
 
249 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.31 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.31 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  40.58 
 
 
255 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.83 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.83 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.83 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.83 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.83 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  40.87 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.61 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  40.58 
 
 
258 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.1 
 
 
263 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  40.1 
 
 
262 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.1 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.98 
 
 
240 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.23 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  40.87 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.68 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  40.58 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.38 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.38 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  43.58 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  37.98 
 
 
258 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  39.13 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.89 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  37.02 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  39.42 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  38.27 
 
 
260 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.5 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.62 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  37.38 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.24 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.98 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.98 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  37.76 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.1 
 
 
263 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  37.24 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 
259 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 
259 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.75 
 
 
257 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  36.59 
 
 
263 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  43.12 
 
 
234 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  43.12 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  45 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  41.14 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  40.37 
 
 
241 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  35.92 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.8 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.86 
 
 
517 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  38.75 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.8 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.33 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  37.41 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.65 
 
 
297 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.11 
 
 
297 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  38.16 
 
 
317 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  33.63 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.45 
 
 
297 aa  92.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.05 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.94 
 
 
311 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.37 
 
 
301 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.81 
 
 
334 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.49 
 
 
333 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  35.81 
 
 
334 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.81 
 
 
334 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.18 
 
 
317 aa  89.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  35.81 
 
 
334 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>