More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3632 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 315 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  99.05 
 
 		 315 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  86.48 
 
 		 318 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  63.95 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  53.51 
 
 		 259 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  49.83 
 
 		 256 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  49.16 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  48.17 
 
 		 258 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  45.21 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  44.63 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  44.95 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.23 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.98 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.53 
 
 		 233 aa  205  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.81 
 
 		 249 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  39.47 
 
 		 495 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  35.25 
 
 		 247 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 		 247 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  36.27 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.39 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  31.92 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  31.17 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 		 262 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  30.62 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  31 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.74 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.9 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.03 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.9 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.12 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  41.21 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.52 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  28.25 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.36 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  38.04 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.56 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 258 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  37.5 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  38.75 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.18 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  41.32 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.37 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  38.37 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.79 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  54.32 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.75 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.94 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  47.56 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  53.66 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  47.56 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.22 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.22 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.32 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  28.81 
 
 		 234 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  39.51 
 
 		 241 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.02 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.31 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.29 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  27.96 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.38 
 
 		 253 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.87 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.31 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.02 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.16 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.76 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  27.63 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  27.96 
 
 		 234 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.41 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.39 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  37.13 
 
 		 263 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.48 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.69 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  47.56 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>