More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3085 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  100 
 
 
263 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.24 
 
 
263 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.62 
 
 
263 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.24 
 
 
263 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.24 
 
 
263 aa  540  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.62 
 
 
263 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  99.62 
 
 
263 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  91.25 
 
 
263 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  78.71 
 
 
262 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  77.19 
 
 
263 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  77.19 
 
 
262 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  79.84 
 
 
258 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.19 
 
 
262 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.05 
 
 
262 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.19 
 
 
262 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  76.43 
 
 
262 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  77.43 
 
 
258 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  71.94 
 
 
257 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.53 
 
 
263 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.14 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  65.98 
 
 
263 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  64.52 
 
 
257 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  64.56 
 
 
262 aa  338  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.94 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.53 
 
 
259 aa  332  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  67.34 
 
 
263 aa  331  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  66.27 
 
 
263 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  66.95 
 
 
263 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  65.48 
 
 
263 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.53 
 
 
262 aa  325  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  59.16 
 
 
258 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  60.74 
 
 
258 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.73 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  56.18 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.92 
 
 
255 aa  298  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  59 
 
 
255 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  56.57 
 
 
259 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  63.72 
 
 
255 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  63.72 
 
 
255 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  55.6 
 
 
259 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.83 
 
 
249 aa  292  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.05 
 
 
261 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  62.62 
 
 
215 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  54.8 
 
 
259 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  53.1 
 
 
260 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  57.66 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  53.11 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
239 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  56.19 
 
 
241 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  50.21 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.75 
 
 
240 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  41.13 
 
 
256 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.13 
 
 
234 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  39.39 
 
 
234 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 
234 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.98 
 
 
259 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.96 
 
 
262 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.39 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.96 
 
 
262 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.4 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 
258 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  37.71 
 
 
234 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.02 
 
 
258 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.86 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.83 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.4 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
262 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
256 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.66 
 
 
247 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 
247 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.04 
 
 
253 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.81 
 
 
266 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
318 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  39.31 
 
 
495 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.61 
 
 
501 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.79 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  37.79 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.71 
 
 
328 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.65 
 
 
326 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.41 
 
 
331 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.09 
 
 
331 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.16 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.32 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 
311 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.38 
 
 
517 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.22 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.53 
 
 
334 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.46 
 
 
199 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.78 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.11 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 
336 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  33.71 
 
 
374 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.95 
 
 
322 aa  85.5  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.03 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.54 
 
 
332 aa  85.5  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.59 
 
 
332 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.96 
 
 
332 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>