More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4244 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 		 266 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  30.09 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  33.59 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  29.63 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.92 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  33.5 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  33.98 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.55 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  30.24 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  30.59 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.94 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  36.99 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.94 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  29.76 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  27.19 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.24 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.23 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.28 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.95 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.95 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.95 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.36 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.5 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.28 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.29 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  29.46 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  28.25 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.81 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  31.68 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  34.25 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.65 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.93 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  34.25 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.88 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.85 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.85 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  25.16 
 
 		 318 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.42 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.22 
 
 		 333 aa  98.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.33 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.71 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.47 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.14 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.53 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.14 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  29.01 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.85 
 
 		 333 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.35 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  26.25 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.78 
 
 		 344 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.92 
 
 		 344 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  29.44 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  25.81 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.36 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.12 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.92 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.92 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.31 
 
 		 366 aa  92.8  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.92 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.92 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.31 
 
 		 366 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.31 
 
 		 366 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3981  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.94 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.43 
 
 		 338 aa  92.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.41 
 
 		 344 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.29 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.29 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.7 
 
 		 328 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  30.81 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  25.94 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.41 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.55 
 
 		 322 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.21 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.68 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.73 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  25.94 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  26.46 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.36 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.93 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.36 
 
 		 332 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.88 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>