More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4302 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  93.52 
 
 		 247 aa  473  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  93.12 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  51.18 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  48.82 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  45.77 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.77 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  45.38 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.53 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.83 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.41 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.41 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.29 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.08 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  41.47 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.99 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.27 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  36.27 
 
 		 315 aa  151  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  38.15 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  37.04 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  35.08 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.2 
 
 		 495 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  35.19 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  36.07 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.65 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.84 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  43.12 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.99 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.01 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  32.37 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.6 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.8 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.91 
 
 		 517 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  30.92 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  32.37 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.2 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.2 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.2 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.05 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  31.62 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.2 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.2 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.45 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  29.96 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  31.62 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.8 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.8 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.51 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.51 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.52 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  33.47 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.39 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.78 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.82 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.92 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  33.02 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  31.54 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  31.72 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  33.83 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.51 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.41 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  33.6 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  39.26 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.8 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.91 
 
 		 301 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.52 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.49 
 
 		 335 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.71 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.1 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.3 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.49 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.28 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.9 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.75 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.75 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.84 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.49 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.94 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.81 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.78 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.39 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  24.07 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.62 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>