More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2994 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  58.72 
 
 
258 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.51 
 
 
263 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  57.26 
 
 
263 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.08 
 
 
263 aa  275  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  58.3 
 
 
258 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  58.37 
 
 
263 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  57.2 
 
 
255 aa  272  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  57.51 
 
 
263 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  57.51 
 
 
263 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  56.84 
 
 
262 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.97 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  56.84 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  57.51 
 
 
257 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.26 
 
 
263 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
262 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
262 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  56.41 
 
 
255 aa  265  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
262 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  56.65 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 
263 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  52.56 
 
 
263 aa  263  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  53.85 
 
 
258 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 
262 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.41 
 
 
263 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.65 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  58.1 
 
 
258 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.85 
 
 
256 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  55.93 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  54.66 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  53.42 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  55.79 
 
 
263 aa  261  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.26 
 
 
262 aa  258  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.6 
 
 
241 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.09 
 
 
215 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  55.96 
 
 
255 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  58.79 
 
 
257 aa  248  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  55.96 
 
 
255 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  49.37 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  54.7 
 
 
241 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  50.21 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  49.57 
 
 
259 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  47.44 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.3 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.71 
 
 
240 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  38.28 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.85 
 
 
234 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.29 
 
 
262 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.29 
 
 
262 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.73 
 
 
256 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.8 
 
 
249 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  37.04 
 
 
234 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.4 
 
 
251 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  38.56 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  38.14 
 
 
234 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  33.99 
 
 
247 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.86 
 
 
234 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.41 
 
 
247 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
247 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.75 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.92 
 
 
266 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.8 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.06 
 
 
319 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.37 
 
 
313 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.89 
 
 
335 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  29.18 
 
 
315 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.17 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.03 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.17 
 
 
495 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.64 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
331 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
331 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
331 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 
318 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.8 
 
 
331 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.13 
 
 
315 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 
331 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
331 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.34 
 
 
318 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.8 
 
 
331 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  39.42 
 
 
326 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.57 
 
 
317 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 
331 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 
344 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
332 aa  88.6  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
374 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
332 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.26 
 
 
331 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.2 
 
 
328 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>