More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3509 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
318 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  86.48 
 
 
315 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  85.53 
 
 
315 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  63.32 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  52.32 
 
 
259 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  48.85 
 
 
256 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  48.01 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.87 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  43.46 
 
 
262 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.17 
 
 
262 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.17 
 
 
262 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.52 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.85 
 
 
249 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.97 
 
 
256 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.66 
 
 
495 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  37.04 
 
 
247 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  36.03 
 
 
247 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
247 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.98 
 
 
253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.77 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 
240 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  32.71 
 
 
249 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  32.36 
 
 
258 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.82 
 
 
259 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
262 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  41.42 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.07 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.04 
 
 
517 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.62 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  32 
 
 
258 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 
259 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  32.03 
 
 
234 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.8 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.67 
 
 
263 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
259 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.52 
 
 
263 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  42.35 
 
 
249 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.59 
 
 
262 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  29.49 
 
 
263 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  29.6 
 
 
256 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  38.69 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.23 
 
 
263 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.23 
 
 
263 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.77 
 
 
263 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.77 
 
 
263 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.77 
 
 
263 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.77 
 
 
263 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.77 
 
 
263 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.16 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  36.75 
 
 
263 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.1 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  38.65 
 
 
257 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  39.29 
 
 
263 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  51.22 
 
 
255 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  51.22 
 
 
255 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  38.12 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  40.48 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  54.88 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.29 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  40.61 
 
 
263 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  40.61 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.16 
 
 
258 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  55.56 
 
 
234 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.2 
 
 
239 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  39.39 
 
 
257 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  35.76 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.65 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  30 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.99 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.37 
 
 
336 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.5 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  53.09 
 
 
234 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  53.09 
 
 
234 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.74 
 
 
344 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.74 
 
 
344 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.74 
 
 
344 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.74 
 
 
344 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.5 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.73 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.5 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.5 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.73 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  28.36 
 
 
241 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.77 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  48.78 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.79 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.61 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.33 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.37 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.95 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.05 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.05 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.8 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>