More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0424 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  59.45 
 
 
227 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  56.11 
 
 
242 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  36.65 
 
 
374 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  41.14 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.22 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.25 
 
 
501 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.75 
 
 
199 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
218 aa  104  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.77 
 
 
221 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.93 
 
 
200 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.74 
 
 
221 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.29 
 
 
197 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  40.56 
 
 
231 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.08 
 
 
221 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  34.18 
 
 
220 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
228 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  33.5 
 
 
234 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.39 
 
 
198 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.48 
 
 
201 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
220 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  30.57 
 
 
215 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  35.58 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  37.76 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.93 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  33.75 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.75 
 
 
204 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.44 
 
 
200 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  33.54 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
231 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.08 
 
 
198 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  27.39 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  33.53 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 
205 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  34.13 
 
 
249 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  27.39 
 
 
197 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  27.39 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
201 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  31.17 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.69 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.37 
 
 
199 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  35 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.62 
 
 
230 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.47 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.64 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
201 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.77 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  30.08 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.39 
 
 
196 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  27.39 
 
 
189 aa  88.6  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  32.77 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.37 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  31.74 
 
 
255 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.46 
 
 
202 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.88 
 
 
204 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.32 
 
 
234 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  33.54 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  30.11 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  35.07 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  32.96 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.42 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  31.36 
 
 
263 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  32.18 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.51 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.98 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  31.1 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  31.61 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  31.61 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.62 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.61 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.46 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.57 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  27.43 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  27.73 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  27.72 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  30.27 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.89 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  29.34 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.32 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>