More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3171 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
220 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  87.73 
 
 
220 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  74.09 
 
 
220 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  68.95 
 
 
229 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.97 
 
 
221 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  65.45 
 
 
220 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  65.61 
 
 
221 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  61.99 
 
 
221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.25 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  48.61 
 
 
228 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  55.98 
 
 
199 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  51.53 
 
 
201 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
201 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  48.98 
 
 
201 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.75 
 
 
197 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 
201 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 
201 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  49.73 
 
 
201 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  47.45 
 
 
197 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  47.45 
 
 
197 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  48.44 
 
 
230 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  52.02 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  49.46 
 
 
205 aa  198  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.4 
 
 
201 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.08 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.43 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  47.92 
 
 
230 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  45.64 
 
 
215 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.41 
 
 
196 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  48.47 
 
 
200 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.25 
 
 
198 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  46.7 
 
 
198 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.73 
 
 
198 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.35 
 
 
230 aa  188  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.03 
 
 
221 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.98 
 
 
204 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 
199 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  45.31 
 
 
202 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.83 
 
 
200 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.13 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  44.39 
 
 
206 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  47.09 
 
 
211 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.83 
 
 
199 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  47.18 
 
 
196 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.74 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  48.09 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  48.07 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  43.81 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.63 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  48.62 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  48.62 
 
 
231 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  46.67 
 
 
231 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  46.2 
 
 
200 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  44.44 
 
 
208 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  44.62 
 
 
205 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  45.26 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.17 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.01 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  40.11 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  39.89 
 
 
189 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.76 
 
 
232 aa  158  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.98 
 
 
200 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.22 
 
 
218 aa  155  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.84 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.92 
 
 
199 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  40.96 
 
 
201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.67 
 
 
204 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  34.18 
 
 
201 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  36.81 
 
 
220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.33 
 
 
204 aa  126  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.11 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  35 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 
227 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  37.65 
 
 
374 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
233 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.12 
 
 
501 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  31.87 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.62 
 
 
532 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26273  predicted protein  38.17 
 
 
601 aa  89  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00964514  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.76 
 
 
258 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.55 
 
 
237 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  35.76 
 
 
259 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.88 
 
 
512 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.76 
 
 
258 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.88 
 
 
512 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.88 
 
 
512 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.99 
 
 
465 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.57 
 
 
512 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.91 
 
 
181 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.19 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  33.97 
 
 
570 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
505 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  32.88 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  32.26 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
531 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  30.27 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>