271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0108 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  87.56 
 
 
215 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  66.67 
 
 
201 aa  287  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  63.18 
 
 
201 aa  284  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  65.17 
 
 
201 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  65.17 
 
 
201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  65.17 
 
 
201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  64.18 
 
 
201 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  56.16 
 
 
202 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.5 
 
 
200 aa  221  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.23 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  52.74 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  51.24 
 
 
211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.92 
 
 
204 aa  217  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  52.74 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  52 
 
 
196 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  50.25 
 
 
199 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  47.21 
 
 
220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.18 
 
 
197 aa  198  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  48.4 
 
 
220 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.47 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  47.47 
 
 
229 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  44.9 
 
 
221 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  49.75 
 
 
201 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  47.06 
 
 
197 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  47.18 
 
 
220 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.32 
 
 
198 aa  191  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  46.7 
 
 
220 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  47.06 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.88 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.5 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.24 
 
 
196 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.37 
 
 
221 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  44.85 
 
 
200 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  46.7 
 
 
228 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.26 
 
 
198 aa  184  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  47.54 
 
 
198 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.18 
 
 
199 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  48.99 
 
 
205 aa  174  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.32 
 
 
221 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  45.69 
 
 
202 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  43.37 
 
 
206 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.75 
 
 
205 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.35 
 
 
229 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  42.25 
 
 
205 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.08 
 
 
207 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  40.11 
 
 
230 aa  157  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  40.66 
 
 
230 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  38.17 
 
 
196 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.71 
 
 
243 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.89 
 
 
230 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  40.56 
 
 
231 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  38.42 
 
 
189 aa  147  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.49 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.01 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  42.39 
 
 
231 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
208 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  41.85 
 
 
231 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  39.67 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.91 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  37.77 
 
 
206 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  39.78 
 
 
231 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  39.34 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.78 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.97 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  34.18 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  35 
 
 
220 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.18 
 
 
204 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.97 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.7 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.46 
 
 
202 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
233 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.47 
 
 
259 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
227 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.56 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 
505 aa  82.4  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 
259 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 
249 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  29.28 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.71 
 
 
505 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.27 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
249 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.27 
 
 
414 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.9 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
259 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
239 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.27 
 
 
414 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  28.1 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  25.75 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  28.3 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.81 
 
 
511 aa  75.1  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  27.81 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.33 
 
 
512 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>