More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2875 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  79 
 
 
221 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.63 
 
 
221 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  75.91 
 
 
221 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  68.18 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  65.45 
 
 
220 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  63.64 
 
 
220 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  63.43 
 
 
220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.46 
 
 
229 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.08 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  47.47 
 
 
228 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.21 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.18 
 
 
201 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.43 
 
 
198 aa  191  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  47.45 
 
 
197 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  46.11 
 
 
215 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  47.18 
 
 
201 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  46.94 
 
 
200 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  47.45 
 
 
197 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.8 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.25 
 
 
198 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  45.64 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  47.54 
 
 
201 aa  185  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  46.99 
 
 
201 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  45.83 
 
 
230 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  46.43 
 
 
198 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
230 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.16 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  48.72 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  46.99 
 
 
201 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.31 
 
 
230 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  46.77 
 
 
211 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  47.31 
 
 
199 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.91 
 
 
199 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  46.77 
 
 
205 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  49.44 
 
 
202 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  47.85 
 
 
199 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  45.79 
 
 
202 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  44.56 
 
 
201 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.13 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.45 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  47.22 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  48.62 
 
 
231 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  48.62 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  41.18 
 
 
189 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  43.08 
 
 
206 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  46.56 
 
 
202 aa  167  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.86 
 
 
199 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  48.07 
 
 
231 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.56 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  45.16 
 
 
196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.27 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  42.86 
 
 
196 aa  161  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  44.09 
 
 
200 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  42.78 
 
 
218 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.09 
 
 
207 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  44.44 
 
 
208 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.62 
 
 
243 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  42.57 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  39.68 
 
 
206 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.38 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.79 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.09 
 
 
200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.25 
 
 
200 aa  145  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  41.05 
 
 
201 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.11 
 
 
232 aa  139  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.78 
 
 
202 aa  126  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.83 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  34.07 
 
 
220 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.31 
 
 
204 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.44 
 
 
204 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
227 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.95 
 
 
520 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.89 
 
 
532 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  36 
 
 
374 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.21 
 
 
531 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  34.39 
 
 
505 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  35.67 
 
 
554 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  36.63 
 
 
531 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
570 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.97 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.78 
 
 
525 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  36.02 
 
 
524 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.73 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.97 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 
528 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 
531 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.35 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 
528 aa  82  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.11 
 
 
155 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.35 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.35 
 
 
512 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
501 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.22 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.99 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.09 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>