More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1055 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  78.22 
 
 
201 aa  319  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.42 
 
 
199 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.91 
 
 
204 aa  228  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  57.43 
 
 
199 aa  220  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  55.45 
 
 
211 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  55.94 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  56 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  55.5 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 
201 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  54.59 
 
 
202 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 
196 aa  207  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  54.5 
 
 
201 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 
201 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  54.64 
 
 
199 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  55.61 
 
 
199 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  51.26 
 
 
215 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  52.43 
 
 
220 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  51 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  50.76 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 
220 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  50 
 
 
221 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.03 
 
 
200 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  51.35 
 
 
229 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.24 
 
 
221 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.5 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  50.8 
 
 
220 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  47.96 
 
 
228 aa  184  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  51.49 
 
 
205 aa  182  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  49.47 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  47.25 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.11 
 
 
197 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.42 
 
 
198 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  47.25 
 
 
197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.11 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.36 
 
 
229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  45.26 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  45.21 
 
 
200 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.09 
 
 
196 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  45.11 
 
 
231 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.41 
 
 
200 aa  164  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.09 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.32 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  44.57 
 
 
231 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  42.08 
 
 
230 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.02 
 
 
243 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  42.55 
 
 
230 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  44.02 
 
 
231 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.24 
 
 
232 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.57 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  44.32 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.21 
 
 
218 aa  153  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  44.27 
 
 
202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.43 
 
 
200 aa  150  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  42.93 
 
 
200 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  40.32 
 
 
196 aa  148  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  37.57 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.16 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.89 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.62 
 
 
205 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  41.62 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  41.49 
 
 
205 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  41.49 
 
 
206 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  40.86 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.55 
 
 
213 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  33.16 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.16 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  35.98 
 
 
220 aa  118  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.67 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.12 
 
 
204 aa  112  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  36.67 
 
 
202 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.71 
 
 
207 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  34.2 
 
 
227 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.63 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 
270 aa  92.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
374 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.16 
 
 
335 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.32 
 
 
501 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.78 
 
 
532 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 
489 aa  87.8  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.14 
 
 
515 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  32.16 
 
 
234 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.94 
 
 
524 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
155 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.14 
 
 
505 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  31 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.97 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.15 
 
 
505 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  35.33 
 
 
523 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.76 
 
 
520 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  31 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26273  predicted protein  41.03 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00964514  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.15 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.53 
 
 
511 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>