More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1040 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  66.33 
 
 
207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  67.84 
 
 
208 aa  279  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  61.54 
 
 
206 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  65.31 
 
 
213 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  51.05 
 
 
201 aa  205  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.95 
 
 
199 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  50.81 
 
 
205 aa  187  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.85 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  46.77 
 
 
221 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.99 
 
 
221 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  44.97 
 
 
206 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.45 
 
 
205 aa  174  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  46.74 
 
 
220 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  44.57 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  46.74 
 
 
220 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  42.39 
 
 
197 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  42.39 
 
 
197 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  46.2 
 
 
220 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  47.37 
 
 
202 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  44.74 
 
 
205 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.48 
 
 
198 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.49 
 
 
229 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  41.85 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.93 
 
 
221 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.02 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.75 
 
 
200 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  47.54 
 
 
231 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  47.54 
 
 
231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  40.98 
 
 
230 aa  161  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  44.09 
 
 
220 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  41.08 
 
 
200 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.53 
 
 
230 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  43.48 
 
 
229 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  44.51 
 
 
199 aa  158  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.02 
 
 
200 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.67 
 
 
196 aa  157  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  46.99 
 
 
231 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  45.36 
 
 
231 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  43.41 
 
 
202 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  43.41 
 
 
199 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.17 
 
 
204 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  41.84 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  41.4 
 
 
201 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  41.3 
 
 
230 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  41.08 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.44 
 
 
198 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  39.67 
 
 
201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.62 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  39.78 
 
 
201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  39.67 
 
 
201 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.67 
 
 
198 aa  150  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.93 
 
 
202 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  43.01 
 
 
211 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.89 
 
 
232 aa  147  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  39.46 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 
196 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.67 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  41.3 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  40.86 
 
 
196 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  37.84 
 
 
201 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  34.72 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.03 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.46 
 
 
243 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  33 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.16 
 
 
204 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.16 
 
 
200 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  39.01 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.18 
 
 
202 aa  111  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.36 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.11 
 
 
204 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.95 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  31.64 
 
 
270 aa  92  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  37.41 
 
 
374 aa  92  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.09 
 
 
237 aa  88.6  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  35 
 
 
528 aa  87.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.57 
 
 
155 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.12 
 
 
501 aa  85.1  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.43 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.71 
 
 
505 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35 
 
 
532 aa  81.3  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.17 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.52 
 
 
525 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.48 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  28.31 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.07 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  33.13 
 
 
528 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
570 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  24.85 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.67 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.7 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.79 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.76 
 
 
263 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.76 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>