293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4470 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  86.07 
 
 
201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  80.1 
 
 
201 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  80.1 
 
 
201 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  79.6 
 
 
201 aa  331  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  70.65 
 
 
201 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  65.17 
 
 
201 aa  281  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  63.18 
 
 
215 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  57.64 
 
 
202 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.27 
 
 
200 aa  222  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.72 
 
 
199 aa  220  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  51.53 
 
 
220 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  50.51 
 
 
220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  54.23 
 
 
211 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  54.77 
 
 
199 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  51.74 
 
 
202 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55 
 
 
202 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  53.81 
 
 
196 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  53.73 
 
 
199 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  48.98 
 
 
229 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.94 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.43 
 
 
221 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  47.96 
 
 
220 aa  194  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.5 
 
 
204 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  52.5 
 
 
201 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  46.94 
 
 
221 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  47.18 
 
 
220 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  44.21 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  43.68 
 
 
197 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  48.04 
 
 
205 aa  185  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.03 
 
 
221 aa  184  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.6 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.41 
 
 
196 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.11 
 
 
198 aa  181  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  44.21 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  50 
 
 
199 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.45 
 
 
198 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  45.18 
 
 
228 aa  174  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.53 
 
 
198 aa  174  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  42.7 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  45.26 
 
 
205 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  42.11 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.62 
 
 
205 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  40.53 
 
 
230 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  44.22 
 
 
202 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.55 
 
 
207 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.31 
 
 
229 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.11 
 
 
213 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  38.95 
 
 
230 aa  154  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  41.4 
 
 
200 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 
196 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.85 
 
 
232 aa  148  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  41.36 
 
 
208 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.3 
 
 
200 aa  147  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.44 
 
 
218 aa  147  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.62 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.13 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  39.25 
 
 
206 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  38.67 
 
 
231 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  37.06 
 
 
201 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  36.9 
 
 
189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.55 
 
 
204 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  38.3 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.96 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  35.91 
 
 
231 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.46 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  35.36 
 
 
231 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.61 
 
 
200 aa  124  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  36.67 
 
 
220 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.05 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.16 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.52 
 
 
202 aa  91.7  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.78 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  29.71 
 
 
242 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  33.58 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.25 
 
 
505 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.75 
 
 
414 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.75 
 
 
414 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  28.77 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.04 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  29.85 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.16 
 
 
465 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
570 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.55 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.87 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.87 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.87 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.8 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  26.32 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  27.4 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.52 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.17 
 
 
505 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26273  predicted protein  36.75 
 
 
601 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00964514  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  24.86 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.74 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>