241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5578 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  71.86 
 
 
202 aa  293  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  73.47 
 
 
196 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  70.35 
 
 
211 aa  291  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  69.85 
 
 
199 aa  286  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.32 
 
 
200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  67.84 
 
 
199 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  59.2 
 
 
204 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  57.43 
 
 
202 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  55 
 
 
215 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  54.23 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.74 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  54.73 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  54.73 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  54.73 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  53.73 
 
 
201 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  53.73 
 
 
201 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.61 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  53.47 
 
 
201 aa  197  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.18 
 
 
221 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  51.91 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
197 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  47.54 
 
 
221 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.56 
 
 
197 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.62 
 
 
221 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  52.72 
 
 
205 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  47.85 
 
 
220 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.1 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  46.56 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  48.09 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  46.5 
 
 
220 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.31 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  47.03 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  46.39 
 
 
198 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.42 
 
 
198 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  43.08 
 
 
205 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.7 
 
 
205 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  44.56 
 
 
228 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  45.05 
 
 
202 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  45.26 
 
 
200 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.23 
 
 
198 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.8 
 
 
199 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  43.41 
 
 
200 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.55 
 
 
221 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.19 
 
 
229 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.08 
 
 
207 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  41.79 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  40.76 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.89 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  39.9 
 
 
230 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.09 
 
 
232 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  42.78 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.89 
 
 
230 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  40.86 
 
 
201 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  38.89 
 
 
220 aa  136  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  40.88 
 
 
218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.44 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.16 
 
 
199 aa  132  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.04 
 
 
243 aa  131  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  36.46 
 
 
196 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  36.84 
 
 
231 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  35.57 
 
 
201 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.75 
 
 
204 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  37.59 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  37.02 
 
 
231 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.78 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  36.46 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.46 
 
 
231 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.11 
 
 
204 aa  103  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.6 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  30.6 
 
 
374 aa  82  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26273  predicted protein  36.2 
 
 
601 aa  78.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00964514  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.77 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  30.99 
 
 
249 aa  72  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.13 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  29.86 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  28.47 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.27 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.51 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 
505 aa  66.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  25.62 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.09 
 
 
465 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  29.14 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  29.14 
 
 
255 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.78 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  27.65 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  27.11 
 
 
255 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.54 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  26.47 
 
 
263 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.88 
 
 
263 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.73 
 
 
501 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  26.47 
 
 
263 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  28.92 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  25.9 
 
 
255 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.11 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>