More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2682 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  55.98 
 
 
220 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6040  oxidoreductase molybdopterin binding  53.06 
 
 
208 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  55.43 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  53.12 
 
 
206 aa  207  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  54.17 
 
 
205 aa  207  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.97 
 
 
205 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  51.63 
 
 
220 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.64 
 
 
202 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  51.06 
 
 
197 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3038  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.76 
 
 
207 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00373285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  50.81 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  53.26 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  51.91 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.51 
 
 
197 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.89 
 
 
221 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  51.61 
 
 
202 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.51 
 
 
198 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  51.91 
 
 
200 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  51.09 
 
 
229 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.65 
 
 
221 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.3 
 
 
198 aa  188  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  48.95 
 
 
200 aa  187  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3262  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.01 
 
 
199 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.54 
 
 
196 aa  187  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.95 
 
 
221 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  47.57 
 
 
221 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  51.1 
 
 
201 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  48.95 
 
 
205 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  46.43 
 
 
196 aa  184  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  51.34 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  43.24 
 
 
189 aa  181  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.62 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.73 
 
 
200 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2760  putative molybdopterin-containing oxidoreductase  44.39 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  51.35 
 
 
202 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  48.91 
 
 
220 aa  177  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  48.11 
 
 
201 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  48.11 
 
 
201 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
201 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  51.09 
 
 
211 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  47.42 
 
 
215 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.24 
 
 
230 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50 
 
 
204 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.18 
 
 
201 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.34 
 
 
198 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  47.57 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  46.49 
 
 
201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  44.09 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  44.09 
 
 
230 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.45 
 
 
213 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  46.7 
 
 
201 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  46.77 
 
 
231 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  47.03 
 
 
231 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.7 
 
 
200 aa  164  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  44.09 
 
 
218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  46.24 
 
 
231 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  45.7 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  47.64 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.62 
 
 
232 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  47.8 
 
 
199 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1907  oxidoreductase molybdopterin binding  45.95 
 
 
201 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  hitchhiker  0.000642174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.86 
 
 
200 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2268  oxidoreductase molybdopterin binding  46.96 
 
 
196 aa  158  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.954043  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.62 
 
 
243 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  37.44 
 
 
201 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.44 
 
 
204 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.67 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  41.98 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.3 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.39 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  40.11 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  42 
 
 
374 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
209 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  35.09 
 
 
270 aa  108  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.84 
 
 
501 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
227 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.14 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.27 
 
 
515 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.96 
 
 
532 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1366  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.64 
 
 
155 aa  91.7  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000000322712  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.3 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.94 
 
 
525 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  37.27 
 
 
524 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 
528 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 
531 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.1 
 
 
335 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 
489 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  33.72 
 
 
234 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.55 
 
 
465 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.89 
 
 
495 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  30.19 
 
 
234 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.97 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
255 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  33.95 
 
 
258 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 
505 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>