More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  61.88 
 
 
227 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  56.11 
 
 
233 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  38.39 
 
 
374 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  45.45 
 
 
231 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  43.51 
 
 
231 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  42.86 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.41 
 
 
198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.08 
 
 
501 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.44 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.51 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.98 
 
 
197 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.53 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  34.42 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
230 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  34.76 
 
 
218 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
230 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  38.16 
 
 
231 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  37.06 
 
 
230 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  30.97 
 
 
263 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  38 
 
 
228 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  34.46 
 
 
200 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.46 
 
 
221 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  40.97 
 
 
220 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  38.31 
 
 
220 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.46 
 
 
221 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.03 
 
 
221 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
197 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  38.99 
 
 
256 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
197 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
198 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.29 
 
 
237 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  37.06 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 
220 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  37.09 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
196 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.14 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.54 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  32.64 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.69 
 
 
200 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.67 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.36 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  38.25 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.05 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.47 
 
 
196 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  34.01 
 
 
234 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.54 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.18 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  30.61 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.33 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.42 
 
 
202 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  34.02 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
201 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.19 
 
 
465 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.63 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.3 
 
 
412 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  34.64 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  34.64 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.63 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
204 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  34.32 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.18 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0133  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
300 aa  89  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158116  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  33.73 
 
 
263 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.67 
 
 
205 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  32.21 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 
259 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.77 
 
 
213 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.54 
 
 
229 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  30.52 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 
305 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.94 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.96 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  34.69 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.52 
 
 
301 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.09 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.96 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  28.76 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  36.43 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.14 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.32 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  32.75 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.23 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  33.78 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>