More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2751 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  83.13 
 
 
249 aa  431  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  60.85 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.2 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  58.16 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.79 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  59.84 
 
 
263 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.45 
 
 
263 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  57.2 
 
 
258 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  57.63 
 
 
258 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  64.45 
 
 
263 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  64.45 
 
 
263 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  57.2 
 
 
258 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.47 
 
 
262 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.47 
 
 
262 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  57.66 
 
 
262 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.06 
 
 
263 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  58.26 
 
 
263 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.06 
 
 
263 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.66 
 
 
263 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  56.4 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.66 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.66 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.66 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.66 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.45 
 
 
262 aa  284  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  57.87 
 
 
255 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  56.85 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  57.2 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  56.78 
 
 
263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.45 
 
 
262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.05 
 
 
263 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.45 
 
 
262 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  57.02 
 
 
259 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  58.47 
 
 
257 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  58.47 
 
 
258 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  53.91 
 
 
259 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  55.14 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  52.59 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  54.55 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  53.88 
 
 
260 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.64 
 
 
256 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.93 
 
 
239 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  56.74 
 
 
255 aa  257  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  56.28 
 
 
255 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.3 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  53.27 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  49.15 
 
 
263 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  51.32 
 
 
241 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
241 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  42 
 
 
259 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.3 
 
 
262 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.3 
 
 
262 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  39.15 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  38.3 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.52 
 
 
251 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  38.49 
 
 
262 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.4 
 
 
256 aa  154  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.05 
 
 
234 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.34 
 
 
249 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  40 
 
 
256 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.87 
 
 
233 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  36.29 
 
 
247 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  35.89 
 
 
247 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  35.08 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.42 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.52 
 
 
234 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.52 
 
 
234 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.52 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  34.91 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.71 
 
 
253 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  32.71 
 
 
318 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.19 
 
 
266 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
315 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  39.88 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  33.53 
 
 
233 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.82 
 
 
318 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 
315 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  32.19 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.96 
 
 
517 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.19 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.91 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.92 
 
 
495 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 
228 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.74 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.64 
 
 
331 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.44 
 
 
200 aa  85.9  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.14 
 
 
331 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.7 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.64 
 
 
311 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.7 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.94 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.74 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.34 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>