More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5020 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  91.57 
 
 		 263 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  80.24 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.82 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.82 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.43 
 
 		 263 aa  430  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.82 
 
 		 263 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.43 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.43 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  79.28 
 
 		 263 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  77.43 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  79.44 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  78.26 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.26 
 
 		 262 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  76.26 
 
 		 262 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.26 
 
 		 262 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.26 
 
 		 262 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  75 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  70.2 
 
 		 263 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  66.02 
 
 		 257 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  64.34 
 
 		 263 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.95 
 
 		 263 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.49 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  63.04 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  61.45 
 
 		 262 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  68.25 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  68.65 
 
 		 263 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.93 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  65.87 
 
 		 263 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  65.48 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  62.81 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  62.81 
 
 		 258 aa  331  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  58.4 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  57.77 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  57.37 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.66 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  56.4 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.14 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.07 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  58.58 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  57.43 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  58.47 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  54.15 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  63.08 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.08 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  40.62 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.89 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.98 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40.69 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.06 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.63 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.63 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.71 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.6 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.93 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.36 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.46 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  36 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  34.32 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.98 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  32.95 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.88 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.26 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 		 319 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.72 
 
 		 501 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.04 
 
 		 495 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.3 
 
 		 311 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.84 
 
 		 334 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.4 
 
 		 336 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.11 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.91 
 
 		 331 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.98 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.57 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.13 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.23 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.54 
 
 		 332 aa  86.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.07 
 
 		 344 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.41 
 
 		 326 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.53 
 
 		 331 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.92 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.54 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.68 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>