More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0316 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 517 aa  1058    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.12 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  42.03 
 
 		 256 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.77 
 
 		 262 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.43 
 
 		 262 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  36.06 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  38.73 
 
 		 262 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  38.42 
 
 		 259 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 		 258 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  34.12 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  33.07 
 
 		 258 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.91 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.91 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  33.91 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.86 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  33.33 
 
 		 280 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  33.33 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  28.96 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.86 
 
 		 233 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.69 
 
 		 280 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  32.26 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  35.88 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.68 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  31.12 
 
 		 299 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.25 
 
 		 256 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.97 
 
 		 253 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  30.04 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.88 
 
 		 256 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  31.3 
 
 		 285 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 		 261 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.4 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.38 
 
 		 263 aa  97.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.97 
 
 		 234 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.38 
 
 		 263 aa  97.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.59 
 
 		 263 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.16 
 
 		 259 aa  95.9  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  34 
 
 		 234 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  31.02 
 
 		 259 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  34.1 
 
 		 258 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 263 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 234 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.12 
 
 		 262 aa  94.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.31 
 
 		 234 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  34.09 
 
 		 242 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 		 319 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  34.55 
 
 		 242 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  33.96 
 
 		 263 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.49 
 
 		 321 aa  93.6  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  35.22 
 
 		 249 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  36.02 
 
 		 255 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.55 
 
 		 263 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 		 262 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  31.96 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.75 
 
 		 258 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  36.02 
 
 		 255 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  30.08 
 
 		 280 aa  91.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 		 259 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  30.09 
 
 		 259 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 258 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  33.96 
 
 		 249 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  35.32 
 
 		 265 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  32.08 
 
 		 263 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.22 
 
 		 240 aa  90.1  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  31.96 
 
 		 290 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  28.66 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 255 aa  88.2  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  29.78 
 
 		 257 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.38 
 
 		 263 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.23 
 
 		 322 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 		 259 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 		 260 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  30.58 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.92 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.93 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.57 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  31.25 
 
 		 257 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.72 
 
 		 317 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  32.42 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.34 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  30.43 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.19 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.77 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.08 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  31.06 
 
 		 258 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.57 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>