19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1039 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  963    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  53.09 
 
 
366 aa  329  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  59.71 
 
 
310 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  52.71 
 
 
544 aa  273  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.99 
 
 
517 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.8 
 
 
495 aa  93.6  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  35.96 
 
 
280 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  27.33 
 
 
242 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  27.33 
 
 
242 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  28.65 
 
 
209 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  40.24 
 
 
280 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  32.65 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  26.36 
 
 
245 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  27.71 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  35.11 
 
 
269 aa  47  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  35.11 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  29.29 
 
 
280 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  30.33 
 
 
209 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  27.94 
 
 
229 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>