108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3846 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  96.69 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  85.53 
 
 		 229 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  41.98 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  42.05 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  39.03 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  40.07 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  38.87 
 
 		 285 aa  168  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  40.44 
 
 		 280 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  40.47 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  39.15 
 
 		 299 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  39.93 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  33.59 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  39.56 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  40.08 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  36.62 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  35 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  30.35 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.08 
 
 		 495 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  30.35 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  35.38 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.09 
 
 		 517 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  33.83 
 
 		 210 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  35.85 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  34.15 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  38.02 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  35.92 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  35.21 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  33.82 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  33.94 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  33.83 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  37.37 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  36.59 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  31.82 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  33.49 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  32.99 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  32.99 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  31.71 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  31.3 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  31.71 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  31.71 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  31.71 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  31.71 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  32.49 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  34.08 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  31.98 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  34.93 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  30.13 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  35.27 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  34.52 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  36.68 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  31.22 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  34.91 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  33.48 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  34.96 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  31.12 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  31.47 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  34.74 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  31.19 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  34.05 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  34.57 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  32.49 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  30.13 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  33.51 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  38.74 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  28.27 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  32.26 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  35.77 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.99 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  27.27 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  34.31 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.9 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  31.08 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  25.66 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.79 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  30 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  35.91 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.97 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  35.91 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.78 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  28.44 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  27.33 
 
 		 492 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1941  (Ni/Fe) hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.11 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.58 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0835  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.43 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  25.22 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0974  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.47 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000584739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  23.23 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  23.33 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1901  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  26.7 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1591  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.33 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  27.88 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.11 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  29.15 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  24.87 
 
 		 310 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  25.86 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>