113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3601 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  94.63 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  63.5 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  57.89 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  57.07 
 
 		 210 aa  224  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  65.17 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  57.65 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  57.22 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  67.2 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  55.21 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  64.58 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  54.07 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  53.37 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  63.54 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  53.33 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  54.12 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  55.44 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  54.69 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  53.37 
 
 		 373 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  50.5 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  51.66 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  51.03 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  54.74 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  52.85 
 
 		 361 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  51.05 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  52.85 
 
 		 378 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  52.85 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  52.85 
 
 		 378 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  52.85 
 
 		 366 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  53.09 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.13 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  52.33 
 
 		 374 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  51.03 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.63 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  52.88 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  52.88 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.04 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  47.17 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  52.36 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  54.21 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  50.76 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  48.21 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  51.83 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  46.67 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  52.33 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  51.02 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  52.06 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  51.31 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  51.05 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  47.89 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  41.98 
 
 		 216 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  43.75 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  41.94 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  35.03 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  31.62 
 
 		 280 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  37.64 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  31.67 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  30.12 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  32.03 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  32.67 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  32.58 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  35.84 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  30.18 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  28.69 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.79 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  30.9 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.48 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.64 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  32.75 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.73 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  30.77 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  33.75 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  23.96 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.18 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  30.97 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  23.28 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  25.64 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.36 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  24.5 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  22.69 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  28.26 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.76 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.51 
 
 		 517 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  27.27 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.42 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  21.72 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  25 
 
 		 571 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.99 
 
 		 757 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>