94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4333 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  100 
 
 
210 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  95.24 
 
 
210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  89.52 
 
 
210 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  89.05 
 
 
210 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  89.05 
 
 
210 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  88.1 
 
 
210 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  77.27 
 
 
366 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  77.27 
 
 
366 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  77.27 
 
 
378 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  77.27 
 
 
378 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  77.27 
 
 
361 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  77.27 
 
 
374 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  76.77 
 
 
373 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  72.55 
 
 
213 aa  299  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  78.71 
 
 
336 aa  297  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  65.09 
 
 
212 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  64.76 
 
 
208 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  62.44 
 
 
210 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  63.54 
 
 
201 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  66.32 
 
 
224 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.9 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  63.54 
 
 
198 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  56.19 
 
 
209 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  62.07 
 
 
203 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  66.32 
 
 
224 aa  234  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  64.06 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  60.61 
 
 
212 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  59.05 
 
 
209 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  57.14 
 
 
210 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.6 
 
 
214 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  62.5 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  59.69 
 
 
223 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  54.19 
 
 
214 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  53.33 
 
 
209 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  54.07 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  55.96 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  53.37 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  50.7 
 
 
212 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  56.25 
 
 
210 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  49.49 
 
 
217 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  56.25 
 
 
211 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  51.03 
 
 
206 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  51.3 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  52.02 
 
 
206 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  47.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  48.48 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  45.23 
 
 
227 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  45.23 
 
 
225 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  51.5 
 
 
204 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  52.1 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  36.15 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  39.07 
 
 
219 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  37.04 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  32.14 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  38.85 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  34.47 
 
 
242 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  33.83 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  29.5 
 
 
288 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  30.81 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  30.5 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  28.46 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  28.85 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  36.53 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  27.63 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  33.7 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.91 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  27.9 
 
 
265 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.24 
 
 
517 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  30.99 
 
 
287 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  31.28 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  28.48 
 
 
285 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  33.33 
 
 
269 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  31.25 
 
 
270 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  33.33 
 
 
266 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.06 
 
 
290 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.61 
 
 
290 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.82 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  23.35 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  31.5 
 
 
544 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  29.81 
 
 
366 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  24.66 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  26.6 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.32 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.64 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  26.06 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  25.26 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  24.48 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.84 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.84 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.84 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.84 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.64 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.8 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.79 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>