90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3724 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  74.24 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  56.48 
 
 		 210 aa  220  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  57.07 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  58.67 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  54.59 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  54.31 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  55.32 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.08 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  62.65 
 
 		 204 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  50.51 
 
 		 214 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  56.92 
 
 		 210 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.04 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  53.37 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  54.81 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  50.54 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  54.59 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  53.12 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  51.79 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  51.3 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  53.57 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  53.16 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  53.23 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  50.51 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  60.84 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  50.76 
 
 		 210 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  51.81 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  50 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  50 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  49.74 
 
 		 374 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  49.48 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  49.74 
 
 		 378 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  49.74 
 
 		 366 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  49.74 
 
 		 378 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  49.74 
 
 		 366 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  49.74 
 
 		 361 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  49.23 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  49.23 
 
 		 373 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  49.5 
 
 		 227 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  50.25 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  50.81 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  48 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  50.52 
 
 		 336 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  53.68 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  50.25 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  46.19 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  49.24 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  51.28 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  49.75 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  49.46 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  36.7 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  33.99 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  40.65 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  34.64 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  33.66 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  33.73 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  32.8 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  33.86 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  28.85 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  37.58 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  32.88 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  35.58 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  36.5 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  35.29 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  31.42 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.69 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  34.01 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  34.93 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  27.69 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  27.98 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  32.76 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.83 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  28.64 
 
 		 495 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.57 
 
 		 517 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  32.52 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  32.52 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.57 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  25.82 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.91 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.13 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  27.46 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.58 
 
 		 290 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.77 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.38 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.47 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  26.39 
 
 		 390 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.23 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.91 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.87 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  23.4 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>