92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1532 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  95 
 
 		 361 aa  567  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  95 
 
 		 378 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  96.11 
 
 		 378 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  90.28 
 
 		 366 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  90.28 
 
 		 366 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  91.76 
 
 		 374 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  88.56 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  78.79 
 
 		 210 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  76.77 
 
 		 210 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  68.44 
 
 		 210 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  78.53 
 
 		 210 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  78.53 
 
 		 210 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  76.96 
 
 		 210 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  68.06 
 
 		 213 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  66.67 
 
 		 212 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  66.32 
 
 		 208 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  62.83 
 
 		 201 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  64.4 
 
 		 198 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.07 
 
 		 210 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  62.83 
 
 		 217 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.26 
 
 		 203 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  62.5 
 
 		 224 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  58.16 
 
 		 209 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  62.5 
 
 		 224 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  61.26 
 
 		 198 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  58.12 
 
 		 212 aa  212  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  60 
 
 		 199 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  60.42 
 
 		 210 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.6 
 
 		 214 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  59.47 
 
 		 223 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  59.09 
 
 		 209 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  57.44 
 
 		 214 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  53.57 
 
 		 210 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  57.44 
 
 		 210 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  56.54 
 
 		 212 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  51.92 
 
 		 209 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  53.37 
 
 		 206 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  55.23 
 
 		 206 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  49.5 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  53.81 
 
 		 211 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  54.08 
 
 		 210 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  49.23 
 
 		 201 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  49.46 
 
 		 207 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  49.24 
 
 		 201 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  43.94 
 
 		 227 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  55.69 
 
 		 204 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  44.95 
 
 		 225 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  56.29 
 
 		 204 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  38.79 
 
 		 216 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  40.52 
 
 		 202 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  35.87 
 
 		 198 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  35.9 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  32.68 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  31.22 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  28.93 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  32.16 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  30.82 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  29.43 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  32.06 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  37.67 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  41.57 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  41.57 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.52 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.63 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  30.71 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.52 
 
 		 207 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  31.9 
 
 		 287 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.35 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  27.2 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  25.53 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  29.82 
 
 		 208 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  30.15 
 
 		 544 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.1 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.16 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.58 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.58 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.58 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.58 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  29.77 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  24.48 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0573  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.05 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.05 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.55 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  27.04 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  23.44 
 
 		 571 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.29 
 
 		 208 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  23.44 
 
 		 566 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>