101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  97.06 
 
 		 204 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  64.06 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  64.58 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  65.45 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  65.62 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  56.46 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  66.83 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  60.75 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  56.37 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  68.42 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  60.2 
 
 		 201 aa  214  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  59.14 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  58.06 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  54.4 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  56.61 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  58.03 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  57.14 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  54.84 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  54.12 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  55.61 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  55.61 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  54.12 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  55.91 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  54.55 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  55.44 
 
 		 374 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  54.55 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  53.89 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  51.55 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  54.92 
 
 		 378 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  54.92 
 
 		 366 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  54.92 
 
 		 378 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  54.92 
 
 		 366 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  54.92 
 
 		 361 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  53.12 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  54.4 
 
 		 373 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  55.38 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  55.91 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  52.15 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  52.13 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  53.23 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  54.92 
 
 		 336 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  51.87 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  51.61 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  51.87 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  53.23 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  51.55 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  42.86 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  46.63 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  44.55 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  36.87 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  32.08 
 
 		 280 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  30.43 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  39.16 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  30.42 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  32.37 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  33.48 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  36.55 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  36.74 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  39.47 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  28.7 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.53 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  31.96 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  34.48 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  31.51 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  30.14 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.74 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  28.88 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  25.59 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  31.5 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  34.65 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  34.65 
 
 		 266 aa  51.2  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  32.09 
 
 		 544 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  23.91 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.35 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.86 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  23.91 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.77 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  23.91 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1090  formate dehydrogenase, gamma subunit  50 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  24.87 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  30.43 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  23.44 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1163  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.03 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.15 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2090  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.03 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.2 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  27.64 
 
 		 285 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  47.06 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  23.44 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  25.81 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  38.46 
 
 		 215 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.81 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2097  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  26.49 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1763  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.95 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>