44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2087 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2570  hypothetical protein  34.27 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0259  hypothetical protein  32.27 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.79 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  27.8 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4395  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  25.22 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  25 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.56 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  22.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  25.21 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  24.32 
 
 		 220 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.46 
 
 		 490 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0837  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.39 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  24.19 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  24.51 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  24.88 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21820  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  24.06 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.137543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0680  formate dehydrogenase gamma subunit  27.68 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.92 
 
 		 491 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.88 
 
 		 208 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.32 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  24.38 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  23.31 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.35 
 
 		 408 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  22.49 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  21.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  20.8 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.88 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  24.35 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.73 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>