130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4395 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  42.65 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  24.71 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.67 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  26.83 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0259  hypothetical protein  25.88 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.36 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0837  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.89 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.11 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  28.18 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  27.63 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0423  hypothetical protein  27.37 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158904  normal  0.64717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  23.14 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1395  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.88 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.798928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1752  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.62 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.125669  hitchhiker  0.000744815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.64 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0301  hypothetical protein  24.83 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0544  iron-sulfur cluster-binding protein  25.75 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  25.3 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2179  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.83 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364942  normal  0.0604921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  23.2 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2570  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2583  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.56 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.62 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  25 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  22.57 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0940  formate dehydrogenase gamma subunit  23.2 
 
 		 401 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3725  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.91 
 
 		 384 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.455366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  22.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  22.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  22.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  24.35 
 
 		 398 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3205  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.48 
 
 		 345 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.97 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3047  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.45 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0243  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.26 
 
 		 529 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.312499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1559  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.57 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1658  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.57 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1739  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.57 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  25.69 
 
 		 321 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1693  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.44 
 
 		 591 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2052  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.67 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.691652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  23.67 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0283  formate dehydrogenase gamma subunit  25.88 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.43 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  23.67 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  23.67 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01434  formate dehydrogenase-N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate-inducible  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2171  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01446  hypothetical protein  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.03 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2181  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1698  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.02 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2088  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.48 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0165  iron-sulfur cluster-binding protein  30.67 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0184855  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0656  iron-sulfur cluster-binding protein  41.38 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0680  formate dehydrogenase gamma subunit  24.38 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.98 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.98 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.98 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.98 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  21.27 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0635  formate dehydrogenase gamma subunit  21.33 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11337 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.28 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0459  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.3 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.07 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1360  iron-sulfur cluster-binding protein  22.15 
 
 		 142 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.58 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.81 
 
 		 335 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.43 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  27.48 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  26.67 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  23.11 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0423  formate dehydrogenase, gamma subunit  20.89 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0391  formate dehydrogenase, gamma subunit  20.89 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.13 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.36 
 
 		 340 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1917  formate dehydrogenase gamma subunit  20.54 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.29 
 
 		 696 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2336  formate dehydrogenase gamma subunit  22.27 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.723504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>