196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2451 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  100 
 
 		 339 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  75.07 
 
 		 341 aa  527  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  58.48 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  57.76 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0459  formate dehydrogenase, gamma subunit  53.59 
 
 		 345 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3205  formate dehydrogenase, gamma subunit  56.07 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0423  formate dehydrogenase, gamma subunit  56.58 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0391  formate dehydrogenase, gamma subunit  56.58 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3128  formate dehydrogenase, gamma subunit  53.75 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  45.37 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0403  formate dehydrogenase gamma subunit  43.04 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0151738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0940  formate dehydrogenase gamma subunit  38.08 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  38.31 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1289  formate dehydrogenase gamma subunit  39.54 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  40.28 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2179  formate dehydrogenase, gamma subunit  37.14 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364942  normal  0.0604921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2583  formate dehydrogenase, gamma subunit  37.59 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0837  formate dehydrogenase, gamma subunit  36.42 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  37.94 
 
 		 398 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1395  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.68 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.798928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  35.65 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  37.16 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  35.37 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  37.85 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1917  formate dehydrogenase gamma subunit  38.06 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  36 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.09 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2788  formate dehydrogenase, gamma subunit  34.53 
 
 		 401 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0675337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003492  formate dehydrogenase -O gamma subunit  31.25 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3461  formate dehydrogenase gamma subunit  34.57 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.293351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3725  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.57 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.455366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  29.81 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  31.79 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  35.37 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4811  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.91 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.48 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0283  formate dehydrogenase gamma subunit  31.49 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  33.9 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  33.9 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  33.9 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  30.26 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.89 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.89 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.89 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.89 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  30.26 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  30.26 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  30.26 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.26 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4214  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.47 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3607  formate dehydrogenase, C subunit, putative  31.42 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2546  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.35 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00375695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.23 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4515  formate dehydrogenase, C subunit, putative  33.47 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4127  formate dehydrogenase, gamma subunit  34.05 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0065  formate dehydrogenase, gamma subunit  31 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4135  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.17 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4415  formate dehydrogenase, C subunit, putative  34.2 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3611  formate dehydrogenase, C subunit, putative  28.66 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4142  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.47 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0227  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.47 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.227237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4419  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.27 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4112  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.47 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0239  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.18 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4131  formate dehydrogenase, gamma subunit  34.48 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4230  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.84 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0331  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.05 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4807  formate dehydrogenase, gamma subunit  34.86 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  31.6 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.7 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.7 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1501  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.57 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.16 
 
 		 696 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1861  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.57 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.7 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.7 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.97 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2138  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  25.39 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.739524  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1682  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.57 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.14 
 
 		 215 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.81 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  28.85 
 
 		 207 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.73 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0355  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  26.8 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.38 
 
 		 211 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.38 
 
 		 211 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.38 
 
 		 211 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  29.19 
 
 		 222 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.38 
 
 		 211 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.38 
 
 		 211 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  32.86 
 
 		 211 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>