166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2336 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2336  formate dehydrogenase gamma subunit  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.723504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0680  formate dehydrogenase gamma subunit  54.94 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0635  formate dehydrogenase gamma subunit  34.41 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1164  formate dehydrogenase gamma subunit  33.61 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.91 
 
 		 491 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2812  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.48 
 
 		 490 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.19 
 
 		 491 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.16 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  28.63 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2546  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.7 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00375695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4214  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.63 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  26.18 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.27 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.85 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0239  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.27 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.64 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3922  formate dehydrogenase, putative  30.94 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.7 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3252  formate dehydrogenase gamma subunit  29.83 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4230  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.74 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  24.89 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0709  formate dehydrogenase gamma subunit  29.83 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  24.89 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0227  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.74 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.227237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4112  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.74 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  25.75 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4142  formate dehydrogenase, gamma subunit  32.08 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1118  formate dehydrogenase, cytochrome B556 subunit  27.23 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4515  formate dehydrogenase, C subunit, putative  31.13 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.75 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  23.65 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  30.19 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  25.76 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0283  formate dehydrogenase gamma subunit  23.24 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1289  formate dehydrogenase gamma subunit  24.69 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  27.5 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0331  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.19 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4415  formate dehydrogenase, C subunit, putative  32.31 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  26.78 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  22.78 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2425  formate dehydrogenase gamma subunit  24.89 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003492  formate dehydrogenase -O gamma subunit  25.32 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  26.03 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.9 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0065  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.19 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  33.33 
 
 		 340 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3607  formate dehydrogenase, C subunit, putative  25.41 
 
 		 323 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  25.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.91 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.13 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  22.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  25.85 
 
 		 398 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  24.58 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3768  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.53 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.32 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0040  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.53 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.59 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4117  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.53 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.35 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3379  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.47 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3881  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.47 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0709  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.39 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.15 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.15 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  22.36 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1681  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.04 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0728  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.04 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3542  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.47 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0474806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  31.86 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1694  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.88 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2394  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.04 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0099056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2257  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.04 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.48 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  21.43 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  23.95 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1090  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.34 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.36319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4595  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.47 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2098  formate dehydrogenase gamma subunit  27.6 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.976655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  25.32 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  23.95 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  23.95 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  22.65 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1901  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.61 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5529  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit gamma  26.38 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.86 
 
 		 408 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.46 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4127  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.14 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>